Manglende overholdelse af reglerne kan fortsat medføre sanktioner i vejledningsperioden. I relation til de enkelte virksomheder, vil det være sådan, at der ved første besøg vejledes om reglerne. Hvis fiskerikontrollen efterfølgende konstaterer, at den samme virksomhed ikke efterlever kravene i konkrete situationer, så vil der blive sanktioneret. Hvis virksomheden ved første kontrolbesøg slet ikke sorterer, kan der sanktioneres.